摘要:在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中，人们习惯于把新的序列同已知功能的蛋白序列作比对。由于这些比对通常都希望能够推测新蛋白的功能，不管它们是双重比对还是多序列比对，都可以回答大量的其它的生物学问题。举例[阅读全文:]
摘要:数据库相似性搜索使我们能够从数据库中存在的数十万个序列中挑选出可能同感兴趣的序列有关联的序列，这个方法有时会导致意想不到的收获。用这种策略获得成功的第一个例子是人们因此发现病毒肿瘤基因v-sis是细胞中[阅读全文:]
摘要:序列比对为两个或更多个序列的残基之间的相互关系提供了一个非常明确的图谱。进行序列比对的目的之一是让人们能够判断两个序列之间是否具有足够的相似性，从而判定二者之间是否具有同源性。值得注意的是，相似性和同源[阅读全文:]
摘要:GenBank数据是以DNA为中心角度的数据报告，也就是以CDS特征为代表的一段编码蛋白质的DNA序列。限定符/translation="MLLYY"描述了将CDS特征翻译成的氨基酸顺序。其它的DN[阅读全文:]
摘要:查询NCBI数据库最简单的方法可能是使用名为Retrieve的邮件服务器。检索服务器通过简单的关键字搜索来查询记录。一次可以检索一个可用的数据库，可以是简单的（只含有一个关键字〕或复合的（含有由逻辑算符[阅读全文:]
摘要:Wisconsin软件包Wisconsin软件包是一个综合性的序列分析软件包，它由120多个独立的程序组成，每个程序进行一项单一的分析任务。由于所有程序输入的序列有统一的格式，所以无论是公用的还是私人的[阅读全文:]
摘要:首先做一个关于如何记录生物高聚物的三维数据的思想实验。考虑一下如何在纸上记录如肌球素这类蛋白质的三维球棒模型的所有细节和尺度关系。一条开始的途径是从由三维模型主干描绘出的氨基酸序列入手。从N’端开始，我[阅读全文:]
摘要:GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。这些文件按类别分为几组：有些按照系统发生[阅读全文:]