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分子进化树构建及数据分析的简介
词条创建者:admin创建时间:12-09 21:50
标签: 生物信息学 分子进化树

摘要:一、方法的选择首先是方法的选择。基于距离的方法有UPGMA、ME(Minimum Evolution,最小进化法)和NJ(Neighbor-Joining,邻接法)等。其他的几种方法包括MP(Maximum parsimony,最大简约法)、ML(Maximum likelihood,最大似然法)[阅读全文:]

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生物信息学常用术语
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:37
标签: 术语

摘要:algorithm(算法): 为完成一个特定任务而进行的一系列动作(例如,一些计算步骤)。browser(浏览器): 用来访问万维网的程序,超文本标识语言(HTML)使得浏览器可以在不同的计算机平台上以[阅读全文:]

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DNA序列的提交
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:37
标签: 序列提交

摘要:要在分子生物学领域进行计算分析,从公共数据库(DDBJ/EMBL/GenBank)中获得DNA序列记录是其必需条件。借助于和一个已了解其生物学功能而被分离出来并测序的基因比较相似性的方法,我们可以尝试确[阅读全文:]

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物理图谱数据库的使用
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:32
标签: 物理图谱

摘要:物理图谱有许多结构和形式。一个极端是限制性图谱(restriction map),用于对小区域、如kb量级做精细结构制图,另一个极端是细胞遗传学图(cytogenetic map),用于对以104 kb[阅读全文:]

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系统发育分析
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:25
标签: 发育 进化 进化树

摘要:系统发育学研究的是进化关系,系统发育分析就是要推断或者评估这些进化关系。通过系统发育分析所推断出来的进化关系一般用分枝图表(进化树)来描述,这个进化树就描述了同一谱系的进化关系,包括了分子进化(基因树)[阅读全文:]

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多序列比对
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:16
标签: 序列比对

摘要:在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中,人们习惯于把新的序列同已知功能的蛋白序列作比对。由于这些比对通常都希望能够推测新蛋白的功能,不管它们是双重比对还是多序列比对,都可以回答大量的其它的生物学问题。举例[阅读全文:]

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数据库中的序列相似性搜索
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:14
标签: 序列相似性 FASTA BLAST

摘要:数据库相似性搜索使我们能够从数据库中存在的数十万个序列中挑选出可能同感兴趣的序列有关联的序列,这个方法有时会导致意想不到的收获。用这种策略获得成功的第一个例子是人们因此发现病毒肿瘤基因v-sis是细胞中[阅读全文:]

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序列比对
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:09
标签: 序列比对

摘要:序列比对为两个或更多个序列的残基之间的相互关系提供了一个非常明确的图谱。进行序列比对的目的之一是让人们能够判断两个序列之间是否具有足够的相似性,从而判定二者之间是否具有同源性。值得注意的是,相似性和同源[阅读全文:]

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NCBI数据模型
词条创建者:darknova创建时间:04-03 09:05
标签: NCBI 数据模型

摘要:GenBank数据是以DNA为中心角度的数据报告,也就是以CDS特征为代表的一段编码蛋白质的DNA序列。限定符/translation="MLLYY"描述了将CDS特征翻译成的氨基酸顺序。其它的DN[阅读全文:]

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NCBI数据库/ENTREZ系统的信息检索
词条创建者:darknova创建时间:04-03 08:58
标签: NCBI ENTREZ

摘要:查询NCBI数据库最简单的方法可能是使用名为Retrieve的邮件服务器。检索服务器通过简单的关键字搜索来查询记录。一次可以检索一个可用的数据库,可以是简单的(只含有一个关键字〕或复合的(含有由逻辑算符[阅读全文:]

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生物信息学技术