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标签: 酵母 表达 多肽 条带

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问:我要表达的多肽是4kd大小,该蛋白是一种抗菌肽.我用的载体是pPIC9,是分泌表达的。先简单说下我前期的工作:

首先我用GS115就做了一次电转化后,MD板长了几个克隆,菌落PCR鉴定阳性率约为20%。然后进一步诱导,先挑单菌落于3mlYPD试管(30ml试管)中摇过夜,然后按1:100接种到10mlBMGY中,诱导大约11h,OD值约2.5。然后置于超净台静止3h,换50mlBMMY培养基继续诱导,每24h补加甲醇至浓度为0.5%。从24d开始取样,连续5天,最后离心取上清。1ml上清TCA浓缩至20ul,然后跑tricine-sds,分离胶、夹层胶和浓缩胶浓度分别为16.5% 10% 4%。已经跑了2个多月的蛋白电泳了,一无所获。做了一次抑菌活性也没有抑菌圈出现。自己分析可能有以下原因,同时希望有经验的战友给些建议,下次应该从那些方面调整一下,先谢过了!!

1)BMGY诱导期od值应在2-6,但不同的od值可能蛋白表达量也不同吧,正在考虑取3、4、5、6不同值进行摸索,不知有没有必要呢?望大家能给些建议!

2)BMGY和BMMY之间的体积比不是很明白,我筛选的表型是Muts,是不是应该BMMY体积小些,这样诱导的菌体密度大些?一直用1:5的体积即10mlBMGY换到50mlBMMY中,也试过1:2也没有结果。不知道这个是不是一个影响因素呢?

3)为防止换液带来的污染,我一直都是静止换液,即测过BMGY od2.5以后静止3h,不知静止过程od值是否改变了很多?

4)甲醇对表达量的影响,好像甲醇添加范围是0.5-2%。 我是添加甲醇到0.5%,用不用提高一下添加量啊?

5)我用的超低分子量marker,3kd-20kd,电泳能跑出来,说明我的胶浓度没问题吧,但是 GS115对照跑不出来,是因为条带太大没分离出来吗

6)还有怀疑浓缩方法是否得当?是不是不同的蛋白针对不同的浓缩方法?

自己先分析了这么多,试验进行不下去了,还耗掉了这么多时间,实在着急啊 希望大家帮看看找找原因,多谢了!!

答1:1、首先要把pPICZ protocol看仔细了,我记得muts型的好象是BMGY 浓缩5倍到BMMY,而您是稀释.

2、换液不要那么苛刻,有污染都没什么问题的,OD值已经那么高了,有杂菌也长不起来的.

3、甲醇0.5%的浓度够了,要有表达,也该出来.

4、测活方法和Tricine胶都没问题,个人觉得还是您样品处理的问题,样品浓缩倍数越高越好.可以冻干后在溶解浓缩; 您再打孔测活,孔干了再加样,看有无活性,然后再做后面的分析和优化,祝好运!

答2:你好我以前也做酵母表达的,我说说我的看法吧:

1、你的电转效率也太低了吧,才长几个。等你用PCR鉴定出阳性不就只剩下一两个克隆了吗?这样少的克隆数做表达,不出来也是很正常啊。

2、在BMGY里还是让OD值高些,大慨到4-5左右,稀释后让OD值到1左右就可以。

3、另外有其他的run小肽胶的方法,你可以试试,可能分辨率会好一些。

4、你可以不浓缩,用银染看看。

主要是觉得你筛选的克隆太少了。

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