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基因芯片相关软件介绍

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1、基因芯片综合分析软件

ArrayVision 7.0

一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。

Arraypro 4.0

Media Cybernetics公司的产品,该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。

phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。

J-express

挪威Bergen大学编写,是一个用JAVA语言写的应用程序,界面清晰漂亮,用来分析微矩阵(microarray)实验获得的基因表达数据,需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后,才能运行。

2、 基因芯片阅读图像分析软件

ScanAlyze 2.44

斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件,进行微矩阵荧光图像分析,包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式,可很容易地转化为任何数据库。

3、 基因芯片数据分析软件

Cluster

斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇(Cluster)分析与其它各种处理的软件。

SAM

Significance Analysis of Microarrays 的缩写,微矩阵显著性分析软件,EXCEL软件的插件,由Stanford大学编制。

4.基因芯片聚类图形显示

TreeView 1.5

斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。

FreeView

是基于JAVA语言的系统树生成软件,接收Cluster生成的数据,比Treeview增强了某些功能。

5.基因芯片引物设计

Array Designer 2.00

DNA微矩阵(microarray)软件,批量设计DNA和寡核苷酸引物工具。

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