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LDR临床检测基因芯片

标签: LDR 临床检测 基因芯片

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基因芯片

生物芯片是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子、组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而判断样品中靶分子的数量。

其反应原理是碱基A-T,C-G间互补配对

而传统芯片的优势和用途是高通量和快速检测。主要应用与大规模检测基因表达差异和大规模药物筛选。但其最大缺点是产生大量假阳性假阴性;同时不是”有”或”无”的结果,使得检测结果的判断非常困难;重复性极差,一般一个样品需重复三次才能做出综合评价。

基于高温连接酶检测反应的基因芯片

原理:当检测到DNA与互补的两条寡聚核昔酸接头对应处存在着碱基错配,则连接反应就不能进行。如图,在同时存在着Cy5标记与Cy3标记的探针时,由于前者与模板DNA互补,故它与下游探针的连接反应得以进行,而后者则无法与下游探针连接。在连接反应结束后进行芯片杂交,检测到的结果即为Cy5,从而可认定该SNP位点为A。

与传统芯片结果比较:结果唯一确定,非此即彼;没有假阳性假阴性结果;操作简单,结果稳定,可重复性强。

芯片结果对比

 

优点

操作简单:对技术人员没有特殊的技术要求,只要接受简单的分子生物学操作培训即可;

成本低:使用本检测系统只需现有的PCR仪等分子实验室仪器即可,无需再投入大量的资金购置仪器。

准确度高:与其他芯片技术的假阴性假阳性相比,LDR技术可以比较准确的检测出DNA多态性;

灵敏度高:点突变率达到1/10-1/50即可检验到,这是测序检测所无法比拟的。

所开发的项目

化疗药物疗效和毒副作用相关位点检测芯片;新生儿氨基糖苷类抗生素致聋检测芯片;乙肝病毒分型及YMDD突变检测芯片;心血管病相关易感基因位点检测芯片。

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