生命经纬知识库 >>所属分类 >> 生物信息学技术   

标签: 基因芯片 分析 血液样品 准备

顶[6] 发表评论(15) 编辑词条

由于血液中的红细胞没有细胞核,用于基因表达分析时,往往是分析血液中白细胞的基因表达情况。因此首先需要把血液中的白细胞进行分离。

下面方法是我们实验室摸索的适合基因芯片技术白细胞分离的过程。

一、实验材料:

淋巴细胞分离液(天津TBD生物技术发展中心);

灭菌生理盐水(普通0.9%生理盐水灭菌即可);

Trizol试剂(Invitrogen公司)

各种取样器具高温灭菌即可;

仪器设备:带水平转头的离心机,

具体过程:以2 ml全血为例

1、将2 mL抗凝血(肝素或者EDTA盐抗凝都可),以3,500 转/分,离心10分钟。将会看到血液分为2层,上层是淡黄色的血浆,约占60%,见图1。


图1 血液抗凝后通过离心分离血细胞和血浆层

2、用巴士滴管或吸管将上层血浆吸出,还剩约1ml血细胞层,在血细胞层中加入1:1体积,即约1ml的灭菌生理盐水,混匀,见图2。


图2 在血细胞中加入生理盐水充分混匀

3、以下是把12ml生理盐水与血细胞混合物(相当于12ml全血)合并成一管后分离白细胞过程。将24 mL淋巴细胞分离液(是全血体积的2倍)预先加入灭菌的50 mL 离心管中。将与生理盐水混合的血细胞缓慢加入淋巴细胞分离液液面上,注意尽量不要让血细胞层掺入到淋巴细胞分离液层去,此过程可见图3;然后以1500转/分,离心20 分钟(离心机要求水平转头)。可以看到液体分为三层,上层是淡黄色的血浆,中间一层乳白色,最下面一层是红色的血细胞。在中间层和上层交界处是有一层白色的膜,即白细胞层,同时在明显的白细胞层下面有较厚的乳白层液体,此层液体中也含有白细胞,但量较少,若血液足够,可以考虑不要此层(若白细胞层不很明显而乳白色液体层太厚,可以2500转/分,继续离心10 分钟以加强白细胞的分离效果),见图4。


  图3 将与生理盐水混合的血细胞缓慢加入    图4 血细胞在淋巴分离液中的分离效果
淋巴细胞分离液液面上                                                                                           

4、用巴士滴管或移液器收集界面上的白细胞层,放入灭菌的1.5 mL EP离心管中,以 10,000 转/分,离心5 分钟,吸掉上清。可见白色的沉淀,有时白色的沉淀上还混有红色的血细胞(少量红细胞无妨),见图5。


图5 分离的白细胞再次离心后形成的沉淀

5、吸去上清液,在细胞沉淀中,加入1ml Trizol试剂,用移液器充分抽打,混匀,直到形成清亮不粘稠度的液体(表明细胞被充分溶解,基因组DNA被充分打断)

6、后续可以按照Trizol试剂的标准操作抽提总RNA。也可以把此Trizol试剂保存在生物冰(低于15℃即可)邮寄给我们,由我们来完成后续的抽提过程。一般每5 ml全血可以得到10-15ug总RNA,得到的总RNA质量如图6所示:


图6 白细胞中抽提RNA的电泳图

注意事项:

A. 在一些方法中,是在全血中直接加淋巴细胞分离液后离心分离红细胞;这样得到的白细胞沉淀中带有较多的血浆蛋白,影响RNA的抽提,因此我们建议用以上方法,先把血浆弃去后再加淋巴分离液。

B. 在一些方法中,分离得到的白细胞先用RNAlater保存进行运输;由于分离的白细胞往往污染有红细胞,红细胞会影响 RNAlater的保存效果;另外,保存在RNAlater中的白细胞在重新回收提取RNA时还有部分损失。

因此若实验室有Trizol试剂,我们建议直接用Trizol试剂把白细胞溶解,在Trizol试剂中的RNA是相对稳定的,-20℃可以保存一个星期,-70℃可以保存一个月。

C. 淋巴细胞分离液一般要求保存在4℃中。淋巴细胞分离液从冰箱取出后,不要马上应用,以避免对细胞冷的刺激,引起基因表达的改变。需待溶液温度升至室温时,混匀后使用。

D. 整个分离过程中,温度应在18-28℃;温度过高与过低均影响分离质量。

附件列表


→如果您认为本词条还有待完善,请 编辑词条

上一篇生物序列联配中的算法 下一篇浅谈对微阵列芯片认识的一些误区

词条内容仅供参考,如果您需要解决具体问题
(尤其在法律、医学等领域),建议您咨询相关领域专业人士。
6

收藏到:  

词条信息

admin
admin
超级管理员
词条创建者 发短消息   

相关词条