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实验步骤
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实验原理
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1 |
所有容器高温灭菌两次,DEPC高温灭菌,所有的试剂用DEPC配制,高温灭菌。 |
去除RNA 酶(外源)的影响。 高温灭菌两次可以破坏RNA 酶的复性过程.虽然RNA 酶极易复性,但两次连续的高温会打乱它的复性历程,从而使RNA 酶失活。 DEPC是RNA 酶的非竞争性抑制剂。DEPC可以与RNA 酶的活性中心的组氨酸咪脞环上的N结合,从而使RNA 酶失活。 因为DEPC能与RNA 的N结合,从而修饰RNA ,所以,必须将DEPC最终除去。在高温灭菌时,DEPC因高温分解而挥发。(UV也能修饰RNA ,实验时应避免。) DEPC灭菌后称为DEPC水,它是不含DEPC的。 实验过程中要勤换手套,必要时要在超净工作台中进行。 |
2 |
在一灭菌2mL管中加入: 5mol/L异硫氰酸胍 0.7mL 苯酚 0.4mL 2mol/L NaAc(pH4.0) 0.1mL |
必须提前准备好变性剂。 异硫氰酸胍可以变性RNA 酶,也可以破细胞。本试验不可以用酶法破细胞。因为蛋白酶K的适合的条件也可以是RNA 酶有活性。 NaAc酸性可以使DNA 在有机相(酚相)中,而在碱性条件下,DNA 和RNA 都在水相中,无法分离,所以,Ph在本是严重很关键。 苯酚用于抽提DNA 和蛋白质。 |
3 |
称取0.2g小麦黄化苗的叶片,迅速在液氮中研磨成粉末,转入已准备好的离心管中。 剧烈震荡。 |
低温防止内源性RNA 酶降解RNA 。 剧烈震荡是使所有的细胞散开,浸在变性剂中。低温的细胞在相对来说高温的液体中是会形成一团,这样就会使内部的RNA 没有水解RNA 的机会。 小麦的黄化苗因为没有光合作用,所以含糖少,易于抽提。 |
4 |
混匀,冰浴30min。 |
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5 |
4℃,12000rpm,10min。 |
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6 |
上清至另一离心管中 加0.4Ml氯仿,剧烈震荡。冰浴放置5min。 |
去脂类。 |
7 |
40C,12000rpm,10min。 |
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8 |
弃有机相(下层) 加入0.4Ml氯仿和0.4Ml酚。室温放置5min。 |
去脂类和蛋白质。 |
9 |
40C,12000rpm,10min 弃有机相,加入等体积异丙醇。-200C放置1h。 |
去糖,脱水。因为体系高盐(2mol/L NaAc),所以可以使RNA 沉淀。 |
10 |
40C,12000rpm,10min 沉淀用70%乙醇洗两次。 |
因为提出的量很少,可能不可见,所以离心是要有方向标记。 |
11 |
室温稍干燥。 |
RNA 是非常不好溶解的,所以只能稍干燥。若不溶解是因为有太多的糖的残余。 |
12 |
沉淀加20uLDEPC水溶解(-200C保存) |
DEPC水中不含RNA 酶。 |
13 |
RNA 电泳 : 1%琼脂糖胶20 mL 8μL样品 1μL样品缓冲液 1μLSYBR 100V恒压电泳 测OD260 和OD260 /OD280 |