由于真菌菌丝体中多糖含量较高，很多方法不易去除干净，不能用于做基因组酶切。

使用如下方法提取菌丝DNA产量高，多糖和蛋白质含量低，符合分子生物学研究要求。

1、取1 g 菌丝体放入冰箱中冻结，然后置于研磨钵中研磨成浆，转入1.5 ml的离心管中；

2、加入0.7 ml提取缓液（0.01 mol.L^-1 Tris.HCl，pH 8.0；2% CTAB，w/v； 0.02 mol.L^-1 EDTA；1.4 mol.L^-1 NaCl；2%巯基乙醇，v/v）；

3、50℃水浴30 min；

4、加入0.7 ml氯仿-异戊醇混合液（24/1， v/v），振荡均匀形成乳浊液；

5、5 000 r.min^-1离心30 min，收集上清液；

6、加入1 ml沉淀缓冲液（0.05 mol.L^-1 Tris.HCl， pH 8.0；1% CTAB，w/v；0.01 mol.L^-1 EDTA）混合均匀，置室温沉淀30 min；

7、然后在5 000 r.min^-1离心15 min，收集沉淀，倒置离心管沥干。将沉淀物悬浮于0.5 ml 1 mol.L^-1 NaCl中，并加2倍体积冷冻无水乙醇，置冰箱中沉淀30 min。5 000 r.min^-1离心15 min，收集沉淀，用1 ml 70%酒精洗涤并于5 000 r.min^-1离心15 min，重复3次，制得DNA沉淀。