ctyw708求助GenBank使用的疑问

众所周知，引物设计常常用到GenBank，但是我查到的是mRNA的序列，用的软件Primer Premier 5.0，里面要输入的是DNA sequence，该如何转换，按照碱基配对原则进行变换（reverse complemently）就可以了？

能利用软件对文献的引物进行评价么？

银色黎明建议

查cDNA序列嘛.

什嘉建议

按照碱基配对原则进行变换（reverse complemently）就可以了？

可以的啦，不过设计时不要弄反了正反义链。

ctyw708建议

Pumed上面查到mRNA的序列，有直接的查询cDNA么？

请问有哪位大侠指点一下blast的用法，听说能检验引物的有效性。

游侠建议

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=PubMed

在search 栏里选gene，for 后面填要找的基因名。

发现你要的基因，点击打开。

看到Genomic regions，transcripts，and products项目，下面有个图，点击可可以打开你要的DNA、mRNA和蛋白质序列。

还有blast应该是验证引物的特异性。