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GenBank使用的疑问

标签: GenBank

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ctyw708求助GenBank使用的疑问

众所周知,引物设计常常用到GenBank,但是我查到的是mRNA的序列,用的软件Primer Premier 5.0,里面要输入的是DNA sequence,该如何转换,按照碱基配对原则进行变换(reverse complemently)就可以了?

能利用软件对文献的引物进行评价么?

银色黎明建议

查cDNA序列嘛.

什嘉建议

按照碱基配对原则进行变换(reverse complemently)就可以了?

可以的啦,不过设计时不要弄反了正反义链。

ctyw708建议

Pumed上面查到mRNA的序列,有直接的查询cDNA么?

请问有哪位大侠指点一下blast的用法,听说能检验引物的有效性。

游侠建议

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=PubMed

在search 栏里选gene,for 后面填要找的基因名。

发现你要的基因,点击打开。

看到Genomic regions,transcripts,and products项目,下面有个图,点击可可以打开你要的DNA、mRNA和蛋白质序列。

还有blast应该是验证引物的特异性。

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