用荧光蛋白去转染293细胞，在荧光显微镜目检下，估计转染效率大约在70-80%之间，可用流式细胞仪检测时，转染效率却只有13%左右。
使用前有先用荧光小球对流式细胞仪进行校准。

如果流式的结果是在阴性对照的基础得出的话，建议采取流式的最终结果，因为人的眼睛敏感度比可能比得上荧光监测器，同时流式可以检测到的细胞数目也不是显微镜下计数可比拟的。

我最近也在做转染的效率的检测，荧光显微镜下可看到近70-80％的阳性细胞，可流式结果近50％，问高人后亦建议取流式结果，如果要提高转染效率可采取轮转的方法，或分选转染成功的细胞进行后续研究。