毛细管电泳（capillary electrophoresis，CE）又叫高效毛细管电泳（HPCE），是近年来发展最快的分析方法之一。1981年Jorgenson和Lukacs首先提出在75μm内径毛细管柱内用高电压进行分离，创立了现代毛细管电泳。1984年Terabe等建立了胶束毛细管电动力学色谱。1987年Hjerten 建立了毛细管等电聚焦，Cohen和Karger提出了毛细管凝胶电泳。1988～1989年出现了第一批毛细管电泳商品仪器。短短几年内，由于CE符合了以生物工程为代表的生命科学各领域中对多肽、蛋白质（包括酶，抗体）、核苷酸乃至脱氧核糖核酸（DNA）的分离分析要求，得到了迅速的发展。

CE是经典电泳技术和现代微柱分离相结合的产物。CE和高效液相色谱法（HPLC）相比，其相同处在于都是高效分离技术，仪器操作均可自动化，且二者均有多种不同分离模式。二者之间的差异在于：CE用迁移时间取代HPLC中的保留时间，CE的分析时间通常不超过30min，比HPLC速度快；对CE而言，从理论上推得其理论塔板高度和溶质的扩散系数成正比，对扩散系数小的生物大分子而言，其柱效就要比HPLC高得多；CE所需样品为nl级，最低可达270fl，流动相用量也只需几毫升，而HPLC所需样品为μl级，流动相则需几百毫升乃至更多；但CE仅能实现微量制备，而HPLC可作常量制备。

CE和普通电泳相比，由于其采用高电场，因此分离速度要快得多；检测器则除了未能和原子吸收及红外光谱连接以外，其它类型检测器均已和CE实现了连接检测；一般电泳定量精度差，而CE和HPLC相近；CE操作自动化程度比普通电泳要高得多。总之，CE的优点可概括为三高二少：高灵敏度，常用紫外检测器的检测限可达10^-13～10^-15mol，激光诱导荧光检测器则达10^-19～10^-21mol；高分辨率，其每米理论塔板数为几十万；高者可达几百万乃至千万，而HPLC一般为几千到几万；高速度，最快可在60s内完成，在250s内分离10种蛋白质，1.7min分离19种阳离子，3min内分离30种阴离子；样品少，只需nl （10^-9L）级的进样量；成本低，只需少量（几毫升）流动相和价格低廉的毛细管。由于以上优点以及分离生物大分子的能力，使CE成为近年来发展最迅速的分离分析方法之一。当然CE还是一种正在发展中的技术，有些理论研究和实际应用正在进行与开发。

“CE”统指以高压电场为驱动力，以毛细管为分离通道，依据样品中各组分之间淌度和分配行为上的差异而实现分离的一类液相分离技术。（见毛细管电泳仪器示意图）。其仪器结构包括一个高压电源，一根毛细管，一个检测器及两个供毛细管两端插入而又可和电源相连的缓冲液贮瓶。在电解质溶液中，带电粒子在电场作用下，以不同的速度向其所带电荷相反方向迁移的现象叫电泳。

CE所用的石英毛细管柱，在pH>3情况下，其内表面带负电，和溶液接触时形成了一双电层。在高电压作用下，双电层中的水合阳离子引起流体整体地朝负极方向移动的现象叫电渗，粒子在毛细管内电解质中的迁移速度等于电泳和电渗流（EOF）两种速度的矢量和，正离子的运动方向和电渗流一致，故最先流出；中性粒子的电泳流速度为“零”，故其迁移速度相当于电渗流速度；负离子的运动方向和电渗流方向相反，但因电渗流速度一般都大于电泳流速度，故它将在中性粒子之后流出，从而因各种粒子迁移速度不同而实现分离。

电渗是CE中推动流体前进的驱动力，它使整个流体像一个塞子一样以均匀速度向前运动，使整个流型呈近似扁平型的“塞式流”。（见图）它使溶质区带在毛细管内原则上不会扩张。但在HPLC中，采用的压力驱动方式使柱中流体呈抛物线型，其中心处速度是平均速度的两倍，导致溶质区带本身扩张，引起柱效下降，使其分离效率不如CE。

理论分析表明，增加速度是减少谱带展宽、提高效率的重要途径，增加电场强度可以提高速度。但高场强导致电流增加，引起毛细管中电解质产生焦耳热（自热）。自热将使流体在径向产生抛物线型温度分布，即管轴中心温度要比近壁处温度高。因溶液粘度随温度升高呈指数下降，温度梯度使介质粘度在径向产生梯度，从而影响溶质迁移速度，使管轴中心的溶质分子要比近管壁的分子迁移得更快，造成谱带展宽，柱效下降。

一般来说温度每提高1℃，将使淌度增加2%（所谓淌度，即指溶质在单位时间间隔内和单位电场上移动的距离）。此外，温度改变使溶液pH值、粘度等发生变化，进一步导致电渗流、溶质分子的电荷分布（包括蛋白质的结构）、离子强度等的改变，造成淌度改变、重复性变差、柱效下降等现象。降低缓冲液浓度可降低电流强度，使温差变化减小。高离子强度缓冲液可阻止蛋白质吸附于管壁，并可产生柱上浓度聚焦效应，防止峰扩张，改善峰形。减小管径在一定程度上缓解了由高电场引起的热量积聚，但细管径使进样量减少，造成进样、检测等技术上的困难。因此，加快散热是减小自热引起的温差的重要途径。液体的导热系数要比空气高100倍。现在有的采用液体冷却方式的毛细管电泳仪可使用离子强度高达0.5mol/L的缓冲液进行分离，或使用200μm直径的毛细管进行微量制备，仍能达到良好的分离效果和重现性。

CE现有六种分离模式，分述如下：

1. 毛细管区带电泳（capillary zone electrophoresis，CZE），又称毛细管自由电泳，是CE中最基本、应用最普遍的一种模式。前述基本原理即是CZE的基本原理。

2. 胶束电动毛细管色谱（micellar electrokinetic capillary chromatography，MECC），是把一些离子型表面活性剂（如十二烷基硫酸钠，SDS）加到缓冲液中，当其浓度超过临界浓度后就形成有一疏水内核、外部带负电的胶束。虽然胶束带负电，但一般情况下电渗流的速度仍大于胶束的迁移速度，故胶束将以较低速度向阴极移动。溶质在水相和胶束相（准固定相）之间产生分配，中性粒子因其本身疏水性不同，在二相中分配就有差异，疏水性强的胶束结合牢，流出时间长，最终按中性粒子疏水性不同得以分离。MECC使CE能用于中性物质的分离，拓宽了CE的应用范围，是对CE极大的贡献。

3. 毛细管凝胶电泳（capillary gel electrophoresis，CGE）是将板上的凝胶移到毛细管中作支持物进行的电泳。凝胶具有多孔性，起类似分子筛的作用，溶质按分子大小逐一分离。凝胶粘度大，能减少溶质的扩散，所得峰形尖锐，能达到CE中最高的柱效。常用聚丙烯酰胺在毛细管内交联制成凝胶柱，可分离、测定蛋白质和DNA的分子量或碱基数，但其制备麻烦，使用寿命短。如采用粘度低的线性聚合物如甲基纤维素代替聚丙烯酰胺，可形成无凝胶但有筛分作用的无胶筛分（Non-Gel Sieving）介质。它能避免空泡形成，比凝胶柱制备简单，寿命长，但分离能力比凝胶柱略差。CGE和无胶筛分正在发展成第二代DNA序列测定仪，将在人类基因组织计划中起重要作用。

4. 毛细管等电聚焦（capillary isoelectric focusing，CIEF）将普通等电聚焦电泳转移到毛细管内进行。通过管壁涂层使电渗流减到最小，以防蛋白质吸附及破坏稳定的聚焦区带，再将样品与两性电解质混合进样，两端贮瓶分别为酸和碱。加高压（6～8kV）3～5min后，毛细管内部建立pH梯度，蛋白质在毛细管中向各自等电点聚焦，形成明显的区带。最后改变检测器末端贮瓶内的pH值，使聚焦的蛋白质依次通过检测器而得以确认。

5. 毛细管等速电泳（capillary isotachor-phoresis，CITP）是一种较早的模式，采用先导电解质和后继电解质，使溶质按其电泳淌度不同得以分离，常用于分离离子型物质，目前应用不多。

6. 毛细管电色谱（capillary electrochromatography，CEC）是将HPLC中众多的固定相微粒填充到毛细管中，以样品与固定相之间的相互作用为分离机制，以电渗流为流动相驱动力的色谱过程，虽柱效有所下降，但增加了选择性。此法有发展前景。

毛细管电泳（CE）除了比其它色谱分离分析方法具有效率更高、速度更快、样品和试剂耗量更少、应用面同样广泛等优点外，其仪器结构也比高效液相色谱（HPLC）简单。CE只需高压直流电源、进样装置、毛细管和检测器。前三个部件均易实现，困难之处在于检测器。特别是光学类检测器，由于毛细管电泳溶质区带的超小体积的特性导致光程太短，而且圆柱形毛细管作为光学表面也不够理想，因此对检测器灵敏度要求相当高。

当然在CE中也有利于检测的因素，如：在HPLC中，因稀释之故，溶质到达检测器的浓度一般是其进样端原始浓度的1%，但在CE中，经优化实验条件后，可使溶质区带到达检测器时的浓度和在进样端开始分离前的浓度相同。而且CE中还可采用堆积等技术使样品达到柱上浓缩效果，使初始进样体积浓缩为原体积的1/10～1%，这对检测十分有利。因此从检测灵敏度的角度来说，HPLC具有良好的浓度灵敏度，而CE提供了很好的质量灵敏度。总之，检测仍是CE中的关键问题，有关研究报道很多，发展也很快。迄今为止，除了原子吸收光谱、电感耦合等离子体发射光谱（ICP）及红外光谱未用于CE外，其它检测手段如：紫外、荧光、电化学、质谱、激光等类型检测器均已用于CE。

与HPLC类似，CE中应用最广泛的是紫外/可见检测器。按检测方式可分为固定波长或可变波长检测器和二极管阵列或波长扫描检测器两类。前一类检测器采用滤光片或光栅来选取所需检测波长，优点在于结构简单，灵敏度比后一类检测器高；后一类检测器能提供时间-波长-吸光度的三维图谱，优点在于在线紫外光谱可用来定性、鉴别未知物。有些商用仪器的二极管阵列检测器还可做到在线峰纯度检查，即在分离过程中便可得知每个峰含有几种物质；缺点在于灵敏度比前一类略差。采用快速扫描的光栅获取三维图谱方式时，其扫描速度受到机械动作速度的限制。用二极管阵列方式，扫描速度受到计算机数据存贮容量大小的限制。由于CE的峰宽较窄，理论上要求能对最窄的峰采集20个左右的数据，因此要很好地选取扫描频率，才能得到理想的结果。