管盖基因芯片是将基因探针固定在特制的管盖内表面，与内置杂交贮液池的Eppendorf管一起构建的基因检测器件。在一个全封闭的管内，完成基因扩增，荧光标记，芯片杂交及检测等一系列生物化学操作，实现多基因高通量并行检测。本文报道了一种用于管盖基因芯片的检测分析系统，它包括光学检测平台、图像采集系统、图像分析系统及结果报告系统。光学检测平台利用尼康显微镜光学系统，通过电荷耦合器件（CCD）的进行图像采集。管盖基因芯片杂交后，经过荧光信号被CCD捕获，经通用串行总线（USB）传递给计算机。图像经过旋转、去噪声点、图像分色、杂交信号判定、有效性判定及结果输出。

我们运用该系统，对于呼吸道十种病毒进行同时检测。实验结果表明，该系统能够准确检测病毒的杂交信号并给出检测结果。