核磁共振（NMR）在体内药物分析中，可用于药物及其代谢物的结构鉴定、代谢途径归属、定量分析以及药物与内源性物质相互作用的研究等。与其它分析方法相比，具有如下优点：

①简便性：无需对样品进行繁杂的提取或衍生化，减少了由此带来的误差；

②无损伤性：对取样量有限的生物样品经NMR分析后还可用于其它处理，甚至可对生物整体进行无损伤分析；

③连续性：NMR可对整体生物系统进行动态监测而不扰乱生物体内的各种平衡，实现药物的在体分析；

④高分辨性：NMR谱线为Hz量级,能提供分子水平的结构信息；

⑤多目标性：无需进行分析条件摸索,，可在同一物理条件下检测药物及其多种代谢物。

1H-NMR 已广泛用于体内药物分析。已报道的有：氨苄青霉素、布洛芬、硝苯地平、阿司匹林、美西律等的体内样品分析。Connor等用高分辨1H-NMR（400MHz）研究了大鼠静注羟氨苄青霉素后24h内尿样中药物的代谢情况。实验用自旋回波技术，消除内源性物质的干扰，增强了测定的灵敏度。尿样中共振信号在0.5～1.7ppm范围内的两组峰为青霉素结构噻唑环C2上的一对偕甲基信号，分辨清晰，测得主要代谢物为5R，6R和5S，6R青霉素与二酮哌嗪。

Murphy等用质子去偶及NOE增益19F-NMR监测接受化疗病人的肝脏中5-FU及其代谢物（FBAL）。Campbell等利用NMR无损伤特性及表面线圈技术，测定了不同剂量抗菌素3-氟甲基青霉素V衍生物在活体SD大鼠体内的药物浓度。将静脉注药后的麻醉鼠置于表面线圈中，用19F-NMR测定鼠膀胱内尿样及胸内药物浓度。

Ogiso等用13C-NMR探讨了脂肪酸对普萘洛尔透皮吸收的影响。实验结果表明：与月桂酸酰胺及甲酯化合物相比，与月桂酸对普萘洛尔透皮吸收的增强作用显著。普萘洛尔制剂中加入月桂酸后，血浆中普萘洛尔浓度明显提高。