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标签: 过氧化氢 细胞 actin 蛋白 提取 影响 western

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DXY网友molihua505提问:这两天做的western,细胞用过氧化氢处理后再提的蛋白。过氧化氢引起细胞损伤,有一些死细胞,我又把培养基中的死细胞离心取沉淀了。 发现浓度较大的组,目的蛋白减少和对照组相比变化不怎么明显,而相对应的actin(肌动蛋白)却比对照少了许多,想问过氧化氢能使actin减少吗,导致过氧化氢处理后内参不应该再用actin了?这是怎么回事啊?

DXY网友yangea回复:首先楼主的操作把培养基中的死细胞离心取沉淀这步是不可取的,在提取细胞总蛋白做western时,应该首先用冷PBS将死细胞漂洗掉。其次,选择内参的原理是其中多数为管家基因,在所有组织中表达较恒定,受外界干扰较小。所有以它们的量为标准,采用归一化处理的方法就可以比较其他蛋白的变化了。actin是细胞骨架蛋白,就具有上述特点。但这种表达的恒定性和受外界干扰小的特性也是相对的。楼主应该参考文献看过氧化氢是否对actin有明显的影响。最后,楼主在做这种半定量western时,是否考虑先对提取的细胞总蛋白大概定个量,以尽量减少上样的差异。

DXY网友Miya回复: 我到是认为并不是细胞作用过氧化氢导致actin表达下降,而是过氧化氢导致目的蛋白表达升高了。因为有死细胞,所以在抽提蛋白的时候,过氧化氢处理组得到的总蛋白量要比对照组低,而actin作为内参理应要低于对照组。而你的目的蛋白处理组和对照组表达差异不明显,如果你扫下蛋白条带的光密度值,用目的/内参得到的值来比较会看得比较清楚。

当然如果楼主怀疑过氧化氢会对Actin的表达产生影响的话,那还是对总蛋白定一下量比较好。或者做考染,看看总蛋白的量是否本来就有区别,还是由于对actin的影响导致的区别。

楼主回复:谢谢以上两位老师的指点,听师姐的建议我昨晚又把膜strip后做的erk,结果还是浓度大的条带淡,应该是我上样量不一致所致。刚提出蛋白来的时候,我本想用考兰G250测浓度的,但开始两个蛋白浓度竟是负值,也不知还是因为仪器坏了,我就没有测。估计着对照组上15 μl,浓度大的上了25 μl,0.75的梳子。立春红预染就发现条带有深浅了。师姐说可以根据显影后条带的浓淡调整上样量,浓度大的组25 μl已经比较极限了,就把其他的上样量降下来,保持actin尽量一致。

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