补体遗传多态性的检测大多分二步进行，第一步是用琼脂糖高压电泳或聚丙烯酰胺等电聚焦电泳将EDTA抗凝血浆通过凝胶电泳，根据分子量的大小、所带电荷的多少及等电点（pI）将血浆蛋白分开。第二步是免疫固定或溶血鉴定，琼脂糖高压电泳或聚丙烯酰胺等电聚焦后，在凝胶板上铺上抗补体某一成分的抗血清，使其与凝胶板上的抗原结合，形成分子量较大的免疫复合物沉淀嵌在凝胶孔中，不易漂洗掉，故称免疫固定。将免疫固定后的凝胶板在生理盐水中漂洗，除去其他蛋白成分。烤干，考马斯亮蓝染色。

依照第六届国际补体定型会议标准或标准品，判断待测样本补体的同种异型。或用溶血法将致敏SRBC和缺乏某一补体成分的豚鼠血清或人血清混合，倾倒在电泳完毕的凝胶板上，凝胶板上的待测补体成分使缺乏的补体成分得以补偿，酶反应发生，导致溶血反应，凝胶板上可出现待测样本补体某一成分的溶血带。

补体C4有两个基因座位，分别为C4A、C4B，两者均表现高度的遗传多态性，现已发现30余种同种异型。C4遗传多态性在人类渊源、法医鉴定及与疾病相关的研究领域受到极大的重视。C4遗传多态性的检测方法可分两种，一种是琼脂糖高压电泳加免疫固定，另一种是琼脂糖高压电泳后加溶血覆盖。在有抗血清的情况下，使用前者简单、方便、易行。仅在C4两个基因座位不易辨别时才采用后者。