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标签: 分子克隆

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一、核酸的纯化

在分子克隆 的所有操作中,最基本的操作是核酸的纯化。其关键步骤是去蛋白质,通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每当需要把克隆 有某一些所用的酶灭活或去除以便进行下一步时,可进行这种抽提。然而,如要从细胞裂解液等复杂的分子混合物中纯化核酸,则要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白质后,再用有机溶剂抽提。这些广谱的蛋白酶包括链霉蛋白酶及蛋白酶K等,它们对多种天然蛋白均有活性,(1)用酚氯仿抽提:这两种有机溶剂合用,比单独用酚抽提的除蛋白效果更佳。继而用氯仿抽提则可除去核酸制品中的痕量酚。①核酸样品置有盖小离心管中,加入等体积的酚/氯仿。②旋涡混匀管内容物,使呈乳状。③12000×g室温离心15秒。④水相移入另一离心管,弃去两相界面和有机相。⑤重复步骤①-④步操作,直至两相界面上见不到蛋白质为止⑦按下述核酸浓缩法沉淀回收核酸。

二、核酸的浓缩

应用最广的核酸浓缩法是乙醇沉淀法。在中等浓度单价阳离子存在下,加入一定量的乙醇后,所形成有核酸沉淀可经离心而回收,甚至对低至pg量的DNA 或RNA,也可定量回收。回收的核酸可按所需浓度,再溶于适当的缓冲液中。

具体操作时,可向含样品的小离心管中加入V/10单价阳离子盐贮存液2V无水乙醇,混匀,放冰水浴中15-30min,取出目测平衡,0-4度,12000g,离心10min。吸弃上清,再另70%乙醇0.5-1ml,12000g,0-4度洗涤离心2min。吸弃上清,沉淀用油泵抽干或打开盖子晾干后,溶于适当体积的缓冲液中。

单价阳离子盐溶液

 

贮存液(mol/L)

终浓度(mol/L)

(醋酸铵*

7.5

2.02.5

LiCl

8.0

0.8

NaCl

2.0

0.2

醋酸钠

3.0pH5.2)

0.3

③DNA 构型:相同分子量的闭环(Ⅰ型),开环(Ⅱ型)和线状(Ⅲ型)DNA ,以不同速率通过凝胶,一般情况下,迁移率Ⅰ型>Ⅲ型>Ⅱ型。④应用的电压:在低电压时,线状DNA 片段的迁移率与所用电压成正比。但是压增高时,大分子量DNA 片段迁移率的增大是不同的,因此琼脂糖凝胶的有效分离范围随电压增大而减小。为了获得DNA 片段的最大分辨力,凝胶电泳时电压不应超过5V/cm。

(二)聚丙烯酰胺凝胶电泳

可用于分析和制备小于1Kb长度的DNA 片段

DNA 在聚丙烯酰胺凝胶中的有效分离范围

丙烯酰胺浓度<%(w/v)>

有效分离范围(bp

3.5

100-1000

5.0

80-500

8.0

60-400

12.0

40-200

20.0

10-100

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  • 更新时间: 2009-12-09

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