藻类、菌类和地衣类均为低等植物。
在形态上无根、茎、叶的分化，是单细胞或多细胞的叶状体或菌丝体，可以分枝或不分枝。
在构造上一般无组织分化，无中柱和胚胎。

藻类:含有光合色素，能行光合作用的自养原植体植物(Thallophates)。
不同的藻类因含特殊的色素，使藻体显不同的颜色。各种藻类的光合作用产物及贮藏养分不同。藻类常含多聚糖、糖醇、、糖醛酸、氨基酸及其衍生物、胆碱、蛋白质、甾醇以及碘、钾、钙、铁等无机元素。
藻类传统分为8个门：红、褐、蓝、绿、裸、轮、金、甲。
    与药用关系密切的藻类主要在褐藻门、红藻门，少数在绿藻门。
    绿藻多数生活在淡水中，极少数在海水中。植物体蓝绿色。贮存的养分主要是淀粉，其次是油类。药用的绿藻有石莼及孔石莼等。
    红藻绝大多数生长在海水中。多数种类呈红色至紫色。贮存的养分通常为红藻淀粉，有的为可溶性红藻糖。药用的红藻有鹧鸪菜、海人草等。
    褐藻是藻类中比较高级的一大类群，绝大多数生活在海水中。植物体常呈褐色。贮存的养分主要是可溶性的褐藻淀粉、甘露醇和褐藻胶，细胞中常含碘，如海带中含碘量高达0．34％。药用的褐藻有海藻、昆布等。

菌类：一般不含光合作用的色素，不能行光合作用，异养的原植体植物。
细菌是单细胞植物，无核有壁。无真正的核，大多数不含叶绿素，细胞壁主要由蛋白质、类脂质和多糖复合物组成，一般不具纤维素壁。
其中放线菌是抗生素的主要产生菌，迄今已知的抗生素中，有2／3是由放线菌产生的，如氯霉素、链霉素、金霉素、土霉素、四环素等。
真菌有核有壁。
真菌都有细胞核，细胞壁大多具有几丁质成分，少数含有纤维素。真菌的营养体除少数原始种类是单细胞外，一般都是由多数分枝或不分枝，分隔或不分隔的菌丝交织在一起，组成菌丝体。储藏的营养物质是肝糖、油脂和菌蛋白，而不含淀粉。
    真菌类中药以子囊菌纲和担子菌纲为最多。
    子囊菌纲的主要特征是在特殊的子囊中形成子囊孢子，如冬虫夏草、蝉花、竹黄等药用菌。
担子菌的主要特征是不形成子囊，而依靠担子形成担孢子来繁殖。药用的部分主要是子实体(如马勃、灵芝等)和菌核(如猪苓、花苓、雷丸等)。
菌类常含多糖、氨基酸、生物碱、蛋白质、蛋白酶、甾醇和抗菌素等成分。其中多糖类如灵芝多糖、茯苓多糖、猪苓多糖、银耳多糖、云芝多糖等有增强免疫及抗肿瘤作用。
菌类中药常见的名词术词有：
1．菌丝  组成真菌的每一根细丝或一个分枝叫菌丝。
2．菌丝体  组成一个真菌菌体的菌丝总称菌丝体。
3．疏丝组织  组成菌丝体的菌丝为长形细胞，且菌线或多或少相互平行排列，这种菌丝组织称为疏丝组织。
4．拟薄壁组织  组成菌丝体的菌丝细胞为椭圆形或近圆形，或近于多角形，这种菌丝组织称为拟薄壁组织。
5．菌核  当外界环境不良、进行休眠时，由菌丝（疏丝组织和拟薄壁组织）形成的坚硬核状体，当条件良好时能萌发产生子实体，如茯苓。
6．子实体  真菌经过有性过程，形成的能产生孢子的结构，称子实体。如灵芝。
7．子座  是容纳子实体的菌丝褥座。子座形成后，常在其上或其内产生子实体。

地衣是藻类和真菌共生的复合体。
形态分为壳状、叶状或枝状。
构造也不相同。枝状地衣内部构造呈辐射状，具有致密的外皮层、薄的藻孢层及中轴型的髓，如松萝科的地衣。
地衣类具特有的地衣酸、地衣色素、地衣多糖、蒽醌类、地衣淀粉。
大约有50%的地衣类含有抗菌活性物质，如抗菌消炎的松萝酸。

[来源]  为马尾藻科植物海篙子Sargassum pallidum （Turn）C. Ag.或羊栖菜Sargassum fusiforme(Harv.)Setch.的干燥藻体。前者习称“大叶海藻”，后者习称“小叶海藻”。
[性状鉴别]  大叶海藻  皱缩卷曲，黑褐色，有的被白霜。
主杆呈圆柱状，具圆锥形突起，主枝自主干两侧生出，侧枝由主枝叶腋生出，具细小的刺状突起。初生叶长5~7 cm，宽约1 cm，披针形或倒卵形，全缘或具粗锯齿；次生叶条形或披针形，叶腋间有着生条状叶的小枝。气囊球形或卵球形，顶端钝圆，有的具细短尖；有的有柄。质脆，潮润时柔软；水浸后膨胀，肉质，粘滑。气腥，味微咸。
    小叶海藻  体较小，长15~40cm。分枝互生，无刺状突起。叶条形或细匙形，先端膨大、中空。气囊腋生，囊柄较长，气囊球形或纺锤形。质较硬。
    [成分]  均含藻胶酸、粗蛋白、甘露醇、钾、碘及马尾藻多糖等成分。
藻胶酸的含量以冬季为高，夏季为低。藻胶酸钠盐有压迫止血作用；甘露醇经硝化成六硝酸甘露醇后，内服有舒张血管及支气管平滑肌作用。

[来源]  为麦角菌科真菌冬虫夏草Cordyceps sinensis（Berk）Sace寄生在蝙蝠蛾科昆虫幼虫上的子座及幼虫尸体的复合体。     [产地]  主产于四川、青海、西藏等省区。甘肃、云南、贵州等省亦产。     [采收加工]  夏初子座出土，孢子未发散时挖取，晒至6~7成干，除去似纤维状的附着物及杂质，晒干或低温干燥。     [性状鉴别]  本品由虫体与从虫体头部长出的真菌子座相连而成。
虫体似蚕，土黄色至黄棕色，偶见棕褐色，粗糙，环纹明显，共有20~30条环纹，近头部环纹较细；
足8对，前3对，中部4对，近尾部1对，以中部4对最明显。
质脆，易折断，断面略平坦，淡黄白色。
子座细长棒状，一般比虫体长，长4~7cm，粗约3mm，深棕色，上部膨大，有不育顶端。
质柔韧，折断面纤维状，类白色。
气微腥，味微苦。
[显微鉴别]  子座头部横切面  类圆形。①周围由1列子囊壳组成，子囊壳卵形至椭圆形；下半部埋生于凹陷的子座内。②子囊壳内有多数线形子囊，每个子囊内又有2~8个线形的子囊孢子。②子座中央充满菌丝，其间有裂隙。④子座先端不育部分无子囊壳。
[成分]  含粗蛋白(25-30%)、氨基酸、脂肪（约8.45%）
D—甘露醇、即虫草酸(cordycepic acid)，
腺苷、虫草素(cordycepin 3’—脱氧腺苷)，
麦角甾醇、虫草多糖、生物碱等。
尚含多种微量元素、维生素、有机酸等。
虫草酸和虫草素是虫草的主要活性物质。
[含量]HPLC测定 腺苷≥0.010%
[附注]混淆品 
1．北虫草 虫草属植物蛹草Cordyceps militalis的子座和虫体
虫体为椭圆形的蛹。子座头部椭圆形，顶端钝圆，橙红色，柄细长。
2．亚香棒虫草 虫草属植物霍克斯草Cordyceps hawkesii的子座和虫体
虫体似蚕，外表菌膜白色，去菌膜成褐色。子实体埋生子座内，无不育顶端。

   [来源]  为多孔菌科真菌灵芝(赤芝)Ganoderma lucidum（Leyss.ex Fr.）Karst或紫芝Ganoderma japonicum(Fr.)Lloyd的干燥子实体。
[性状鉴别]  灵芝  菌盖半圆形、肾形或数个重叠或粘连而呈不规则形，直径5~10cm：偶可达30 cm，厚o．4~1．8cm；表面红褐色，有光泽，环状棱纹明显，辐射状皱纹清楚或不清楚，中间厚，边缘薄而常向内卷；菌盖下表面菌肉白色至浅棕色，扩大镜下观察可见极细小的针眼状小孔（菌管口）；菌盖木栓质，纵切面米黄色至浅褐色，菌管层棕褐色。菌柄侧生，扁圆柱形，常弯曲，长3~11cm，直径o．3~1．3 cm；红褐色至紫褐色，有漆样光泽。气微，味苦。
    紫芝  子实体形状与灵芝极相似，主要区别为：菌盖与菌柄表面紫黑色或黑色，有光泽，具明显的同心环沟，菌肉锈褐色。

    [来源]  多孔菌科真菌茯苓Poria cocos （Schw.）Wolf的干燥菌核。
[产地]  主产于安徽、云南和湖北。广东、广西、四川等省亦产.
    [采收加工]  多于7~9月采挖，挖出后除去泥沙，堆置“发汗”后，摊开晾至表面干燥，再“发汗”，反复数次至现皱纹，内部水分大部散失后，阴干，称为“茯苓个”；或将鲜茯苓按不同部位切制，阴干，分别称为“茯苓皮”及“茯苓块”。
[性状鉴别]  茯苓个  呈类球形、椭圆形或不规则的块状，大小不一。
外皮薄而粗糙，棕褐色至黑褐色，有明显隆起的皱纹。
体重，质坚实，不易破裂，断面不平坦，外层淡棕色，内部白色，显颗粒性，有的具裂隙，，少数淡红色，有的中间抱有松根。
无臭，味淡，嚼之粘牙。
    以体重、坚实、外皮包棕褐、皮纹细、无裂隙、断面白色细腻、粘牙力强者为佳。
    茯苓皮  为削下的茯苓外皮。形状大小不一。外面棕褐色至黑褐色，内面白色或淡棕色，体软质松，略具弹性。
    茯苓块  为去皮后切制的茯苓，呈块片状，大小不一。白色、淡红色或淡棕色。
[显微鉴别]  粉末：灰白色。
①水装片，可见无色不规则颗粒状团块或末端钝圆的分枝状团块。
②用水合氯醛液装片，团块溶化露出菌丝。菌丝细长，稍弯曲，有分枝，无色或带棕色(外层菌丝)，直径3~8μm，稀至16μm，横壁偶可察见。
③粉末加α—萘酚及浓硫酸，团块物即溶解，可显橙红色至深红色。
④不含淀粉粒及草酸钙晶体。
[成分]  菌核主含β—茯苓聚糖(β—pachyman)，
并含多种四环三萜酸类化合物：茯苓酸(pachymic acid)、齿孔酸(ebricoic acid)、块苓酸、松苓酸等。
此外，尚含麦角甾醇、胆碱、腺嘌吟、卵磷脂等。
    茯苓聚糖无抗肿瘤活性；若切断其支链，成为茯苓次聚糖(pachymaran)则显抗肿瘤活性。
    [理化鉴别]
    (1)丙酮回流提取物加l冰醋酸使溶解，再加硫酸l滴，显淡红色，后变淡褐色。(麦角甾醇反应)
    (2)茯苓粉末，加碘化钾碘试液l滴，显深红色。(为多糖类的显色反应)

[来源]  为多孔菌科真菌猪苓Polyporus umbellatus(Pers.)Fries的干燥菌核。
[产地]  主产陕西和云南省。河南、山西、甘肃等省亦产。人工栽培已获成功。 [采收加工]  春、秋两季采挖，去净泥沙，干燥。 [性状鉴别]  呈不规则条块状，有的有分枝，长5~25cm，直径2~6cm。
表面皱缩或有瘤状突起，灰黑色或棕黑色。
质致密而体轻，能浮于水面，
断面细腻，类白色或黄白色，略呈颗粒状。气微，味淡。
[显微鉴别]  粉末：灰黄白色。
①菌丝团大多无色(内部菌丝)，少数棕色(外层菌丝)。散在的菌丝细长、弯曲，直径2~10μm，有的可见横隔，有分枝及结节状膨大部分。
②草酸钙方晶众多，呈双锥八面体形，或不规则多面体形，直径3~32~60μm，长至68μm，有时可见数个结晶聚集在一起。
    [成分]  含水溶性多聚糖化合物猪苓聚糖I(Gu—I)、麦角甾醇(ergosterol)、α—羟基二十四碳酸、生物素(维生素H)、粗蛋白等。
    猪苓多糖有抗肿瘤作用，对细胞免疫功能的恢复有明显的促进作用。
    [理化鉴别]
(1)粉末加稀盐酸10m1，置水浴上煮沸15min，搅拌，呈粘胶状。
另取粉末少量，加氢氧化钠溶液(1→5)适量，搅拌，呈悬浮状。
    (2)取粉末0.5g，加甲醇5m1，于水浴上加热2min，滤过，滤液蒸干，残渣溶于1ml冰醋酸中，加醋酐—硫酸试剂(19：1)1m1，颜色迅速由红变紫、青，最后变为绿色。(检查麦角甾醇)

    [来源]  为松萝科植物松萝Usnea diffracta Vain.或长松萝Usnea longissima Ach.的干燥地衣体。
    [性状鉴别]  松萝  呈二叉状分枝，主枝基部直径0.8~1.5mm，越向先端分枝越多越细。灰绿色或黄绿色，粗枝表面有明显的环状裂纹，故称“节松萝”。质柔韧，略有弹性，不易折断，断面可见中央有线状强韧的中轴。气微，味酸。
    长松萝  主轴单一，不呈二叉状分枝，两侧侧枝密生，侧枝长0．3~1．6cm，似蜈蚣足状，故名“蜈蚣松萝”。灰绿色。质柔软。