摘要:做SNP genotyping应该常看的几个database:1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe International HapMap Project i[阅读全文:]
摘要:关于snp位点的命名其实并不统一,大家在文献中一般用的都是习惯或者说惯用名称。具体表现在以下几种形式:一、突变信息之间加上位置信息主要有三种方式:比如说突变信息之间加上cDNA的位置,如C188T;突变信息之间加上DNA的[阅读全文:]
摘要:以检索NAT2的不同SNP的基因序列为例:1、Genbank里的dbSNP数据库中有详细的信息,方法如下:(1)进入NCBI的主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/,然后,Search下拉菜单中选“ SNP”,搜索for “NAT2”。(2[阅读全文:]
摘要:1、引物的长度一般为15-30bp,常用的是18-27bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74°C,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2、引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导[阅读全文:]
摘要:1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及[阅读全文:]
摘要:比较详细,适合SNP初学者!点击下面链接下载SNP检测方法(讲课版).ppt[阅读全文:]
摘要:High-throughput SNP genotyping by single-tube PCR with Tm-shift primer PDF文档下载[阅读全文:]
摘要:生命经纬网友atcg提到:1 、把蛋白序列对应的核酸序列找到。2 、根据核酸序列做BLAST (对dbSNP数据库http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snpblastByChr.html)。3 、结果中,可以得到你的序列上所以已知的SNP。生命经纬网友free[阅读全文:]